C помощью Nautilus можно просматривать и управлять не только файлами и каталогами, размещенными на локальном ПК, но и на FTP-сайтах, расшаренных SMB-ресурсах windows-компьютеров, файловых системах мобильных телефонов, HTTP-, WebDAV- и SFTP-серверах, а также в "облачных" хранилищах данных, таких как, например, Google Диск.
Поддерживаются закладки, изменение фона окон, вставка примечаний, сохранение истории посещенных папок; для локальных файлов производится отслеживание их изменений в режиме реального времени.
- подключение и отключение устройств для хранения данных; - просмотр миниатюр файлов, включая видеоролики, изображения, PDF, DJVU и текстовые файлы; - установка эмблем (маленьких значков, которые можно навешивать на файлы и папки для выделения их среди себе подобных); - просмотр свойств файлов и каталогов; - создание, изменение, удаление файлов и каталогов; - запуск приложений и сценариев; - уведомление о рискованных операциях; - поиск файлов и каталогов; - выполнение других действий через дополнения и сценарии; - поддержка горячих клавиш для работы как с файлами и каталогами, так и окнами и вкладками.
Система шифрования дисковых разделов, являющаяся форком TrueCrypt. Поддерживается использование для шифрования нескольких алгоритов, начиная от AES и заканчивая отечественными стандарами шифрования
